ISSN: 0377-9777 / e-ISSN: 1308-2523
Determination of Hepatitis C virus genotype and HCV infection transmission routes in Cukurova University Medical Faculty Hospital [Turk Hij Den Biyol Derg]
Turk Hij Den Biyol Derg. 2017; 74(3): 201-210 | DOI: 10.5505/TurkHijyen.2017.24471

Determination of Hepatitis C virus genotype and HCV infection transmission routes in Cukurova University Medical Faculty Hospital

Alev Çetin Duran1, Filiz Kibar1, Salih Çetiner2, Akgün Yaman1
1Department of Medical Microbiology of Cukurova University Medical Faculty Hospital, Adana
2Central Laboratory of Cukurova University Medical Faculty Hospital, Adana

INTRODUCTION: Determination of the HCV genotype is critical in management of HCV infection which causes chronic liver failure. In this study, we examined blood samples of patients which have been sent to the Central Laboratory of.. University Medical Faculty Hospital for HCV genotyping and we investigated transmission routes of HCV infection retrospectively by searching patients’ history.
METHODS: Between January 2015-August 2016, HCV genotypes of 119 HCV-RNA (COBAS AmpliPrep / COBAS TaqMan HCV real-time PCR, Roche Diagnostics, Germany) positive patients results were analyzed retrospectively in Central Laboratory of.. University Medical Faculty Hospital. The demographic data of patients were obtained from the hospital electronic information system and patient files. “Sacace HCV Genotype Plus Real TM” kit was used for HCV genotyping which can detect genotype 1a, 1b, 2, 3, 4, 5a, 6 by real-time PCR method.
RESULTS: Of the 119 patients, genotype 1 was detected in 71.4% (12.6% genotype 1a, 58.8% genotype 1b), genotype 3 in 16.8%, genotype 2 in 7.6%, genotype 4 in 3.4%. Genotype 5 (5a) (0.8%) which has not been reported previously in Adana, was determined in a Syrian female patient. 45.0% of patients who were infected with genotype 3 and 33.3% of patients with genotype 2 infection were intravenous drug users (IVDUs); and young men (83.3%) constituted the majority of this patient group. In addition, genotype 3 infection was detected in 4 patients who were have a risk for being IVDU with psychiatric disorders and suicide attempt. Among 11 Syrian patients with HCV infection, almost all of the infections were associated with medical interventions, the HCV genotypes detected were as follows; 63.6% genotype 1a, 27.3% genotype 4 and 9.1% genotype 5a.

DISCUSSION AND CONCLUSION: Epidemiology of HCV infection in Turkey varies in recent years. Although medical interventions are the main risk factor and genotype 1b infection prevalence is 85-90% in our country, genotype 1b infection prevalence has been decreasing in recent years. The incidence of other genotypes are increasing and undetected genotype 5 infection has been determined in Syrian immigrants in our country. Genotype 2 and genotype 3 infections which are associated with intravenous drug use have been increased in southern Turkey, such as Adana. Although transmission risk of HCV infection with medical interventions has decreased with increasing infection control measurement practice, the increasing number of IVDUs will be important in the HCV infection transmission in the future.

Keywords: HCV genotypes, risk factors, intravenous drug use, genotype 5 infection

Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi’nde Hepatit C virus genotiplerinin ve HCV enfeksiyonu bulaş yollarının belirlenmesi

Alev Çetin Duran1, Filiz Kibar1, Salih Çetiner2, Akgün Yaman1
1Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı, Adana
2Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi Balcalı Hastanesi Merkez Laboratuvarı, Adana

GİRİŞ ve AMAÇ: HCV’nin neden olduğu kronik karaciğer hastalığının tedavi ve takibinde genotiplerin belirlenmesi kritik öneme sahiptir. Bu çalışmada, HCV genotiplemesi için..Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Merkez Laboratuvarına gönderilen kan örneklerinde elde edilen sonuçlar ve hasta dosya bilgileri kayıtlardan incelenerek bölgemizdeki HCV genotiplerinin dağılımı ve bulaş yolları belirlenmiştir.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Ocak 2015-Ağustos 2016 tarihleri arasında.. Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Merkez Laboratuvarında, HCV-RNA (COBAS AmpliPrep/COBAS Taq Man HCV real-time PCR, Roche Diagnostics, Germany) pozitif saptanan hastalardan HCV genotip tayini yapılan 119 hastaya ait sonuçlar kayıtlardan incelendi. Hastaların demografik verileri, hastane elektronik bilgi sisteminden ve hasta dosyalarından elde edildi. Genotipleme için genotip 1a, 1b, 2, 3, 4, 5a, 6’yı gerçek zamanlı PCR yöntemi ile saptayan “Sacace HCV Genotype Plus Real TM” kiti kullanıldı.
BULGULAR: 119 hastadan oluşan çalışma grubunda %71.4 genotip 1 (%12.6 genotip 1a, %58.8 genotip 1b), %16.8 genotip 3, %7.6 genotip 2, %3.4 genotip 4 enfeksiyonu saptandı. Suriyeli kadın hastada, Adana’da daha önce bildirilmemiş olan genotip 5a (%0.8) enfeksiyonuna rastlandı. Genotip 3 enfeksiyonu saptanan hastaların %45.0’inde ve genotip 2 enfeksiyonu saptanan hastaların %33.3’ünde damar içi uyuşturucu (DIU) kullanımı söz konusu olup çoğunluğunu genç erkek (%83.3) hastalar oluşturmakta idi. Ayrıca psikiyatrik hastalığı ve intihar girişimi öyküsü olan ve DIU kullanımı açısından riskli dört hastada da genotip 3 enfeksiyonu tespit edildi. Tamamına yakını tıbbi uygulamalarla ilişkili olan Suriyeli 11 hastadaki HCV genotiplerinin dağılımı sırasıyla %63.6 genotip 1a, %27.3 genotip 4 ve %9.1 genotip 5a olarak belirlendi.

TARTIŞMA ve SONUÇ: Türkiye’de HCV enfeksiyonunun epidemiyolojisi son yıllarda değişiklik göstermektedir. Her ne kadar ülkemizde tıbbi uygulamalar temel risk faktörü ve genotip 1b enfeksiyonu prevelansı %85-90’larda olsa da son yıllarda genotip 1b enfeksiyonunun prevelansı azalmaktadır. Diğer genotiplerin görülme sıklığı artmakta ve Suriyeli göçmenlerde daha önce ülkemizde saptanmayan genotip 5 enfeksiyonlarına rastlanmaktadır. Adana gibi Türkiye’nin güneyindeki illerde DIU kullanımı ile ilişkili genotip 2 ve özellikle genotip 3 enfeksiyonlarında artış görülmektedir. Tıbbi uygulamalarda güvenliğin artırılması HCV enfeksiyonu riskini azaltsa da, DIU kullanımının artması, gelecekte de HCV enfeksiyonunun önemini koruyacağını göstermektedir.

Anahtar Kelimeler: HCV genotipleri, risk faktörleri, damar içi uyuşturucu kullanımı, genotip 5 enfeksiyonu

Alev Çetin Duran, Filiz Kibar, Salih Çetiner, Akgün Yaman. Determination of Hepatitis C virus genotype and HCV infection transmission routes in Cukurova University Medical Faculty Hospital. Turk Hij Den Biyol Derg. 2017; 74(3): 201-210

Corresponding Author: Alev Çetin Duran, Türkiye
Manuscript Language: Turkish
LookUs & Online Makale