ISSN: 0377-9777 / e-ISSN: 1308-2523
Analysis of Nosocomial Pneumonia and Antimicrobial Resistance of Frequently Encountered Bacterial Isolates in Intensive Care Unit Patients [Turk Hij Den Biyol Derg]
Turk Hij Den Biyol Derg. 2016; 73(4): 355-364 | DOI: 10.5505/TurkHijyen.2016.84755

Analysis of Nosocomial Pneumonia and Antimicrobial Resistance of Frequently Encountered Bacterial Isolates in Intensive Care Unit Patients

Yasemin Genç1, Yakup Gürkan1, İpek Mumcuoğlu1, Dilek Kanyılmaz2, Altan Aksoy1, Neriman Aksu1
1Ankara Numune Training And Research Hospital, Medical Microbiology, Ankara
2Ankara Numune Training And Research Hospital, Infection Control Committee, Ankara

INTRODUCTION: In this study, we aimed to investigate the distribution of species, resistance patterns and infection- colonization rates of hospital acquired pneumoniae (HAP) isolates which isolated from lower respiratory tracts of the patients hospitalized in intensive care units (ICU).
METHODS: In this study, we retrospectively analyzed 1119 lower respiratory tract samples [96 sputum, 1023 endotracheal aspirates (ETA)] with positive culture results, and obtained between June 11, 2012- January 01, 2014. Quantitative cultures were done in ETA samples, and qualitative cultures were done in sputum samples. The infection-colonization differentiation of the bacteria grew on culture was done by Infection Control Committee of our hospital, in accordance with CDC criteria. Identification and antibiotic susceptibility tests were performed by using Vitek-2 (bioMerieux, France) automated system.
RESULTS: A total of 1309 microorganisms were isolated from 1119 samples obtained from 678 patients. Among those microorganisms, 962 isolates from 401 patients were considered as colonization, and 347 microorganisms isolated from 277 patients were considered as causative agents. Causative agents from ETA material is 338 and nine causative agents are produced from sputum materials. The most frequently isolated microorganisms in ETA materials were Acinetobacter baumannii (208, 61.5%), Pseudomonas spp. (53, 15.6%), Klebsiella pneumoniae (20, 5.9%), Staphylococcus aureus (18, 5.3%), and Escherichia coli (9, 2.6%), in sputum materials were Acinetobacter baumannii (6, 66.6%), Pseudomonas spp. (2, 22.2%), Klebsiella pneumoniae (1, 11.1%). The microorganisms regarded as colonization were A.baumannii (272, 28.3%), Enterobactericae spp. (228, 23.7%), Pseudomonas spp. (131, 13.6%), and Candida spp. (138, 14.3%). All frequently isolated species, namely A. baumannii, Pseudomonas spp. and K. pneumoniae had multiple antimicrobial resistances. Among nosocomial pneumonia (HAP), 235 were considered as ventilator-associated pneumonia (VAP), and 63 were considered as non-VAP NP.
DISCUSSION AND CONCLUSION: HAP is frequently seen in ICUs, and it has a high mortality rate. Determining the bacteria causing HAP in ICUs, and their antimicrobial susceptibilities is important for future empirical therapies, and to reduce mortality and morbidity. Since most of NP cases appear late during hospitalization, it is evident that duration of hospital stay is an important risk factor for NP. The most frequent causative agent was A. baumannii, and colistin was determined as the only treatment option. It must be kept in mind that colonized microorganisms may be causative infectious agents in time, and the patients should be followed up.

Keywords: Hospital acquired pneumonia, ventilator-associated pneumonia, antimicrobial resistance, colonization

Yoğun Bakım Hastalarında Hastane Kaynaklı Pnömoni Olgularının Değerlendirilmesi ve Sık Görülen Bakteriyel Etkenlerin Antimikrobiyallere Dirençlerinin Araştırılması

Yasemin Genç1, Yakup Gürkan1, İpek Mumcuoğlu1, Dilek Kanyılmaz2, Altan Aksoy1, Neriman Aksu1
1Ankara Numune Eğitim Ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji, Ankara
2Ankara Numune Eğitim Ve Araştırma Hastanesi, Enfeksiyon Kontrol Komitesi, Ankara

GİRİŞ ve AMAÇ: Bu çalışmanın amacı; hastanemiz yoğun bakım ünitelerinde (YBÜ) yatmakta olan hastalardan alınan alt solunum yolu örneklerinden izole edilen hastane kaynaklı pnömoni (HKP) etkenlerinin tür dağılımlarını, direnç paternlerini ve etken-kolonizasyon oranlarını saptamaktır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Çalışmada 11.06.2012-01.01.2014 tarihleri arasında üreme saptanan 96 balgam, 1023 endotrakeal aspirat (ETA) olmak üzere 1119 alt solunum yolu örneği retrospektif olarak değerlendirilmiştir. ETA örneklerine kantitatif kültür, balgam örneklerine kalitatif kültür yöntemleri uygulanmıştır. Üreyen mikroorganizmaların etken-kolonizasyon ayrımı hastanemiz Enfeksiyon Kontrol Komitesi tarafından CDC kriterlerine göre yapılmıştır. İdentifikasyon ve antibiyotik duyarlılık testleri Vitek-2 (bioMerieux, France) otomatize sistemiyle çalışılmıştır.
BULGULAR: Toplam 678 hastadan alınan 1119 örnekten 1309 mikroorganizma izole edilmiştir. Bu mikroorganizmalardan 401 hastaya ait 962 mikroorganizma kolonizasyon, 277 hastaya ait 347 mikroorganizma ise etken olarak kabul edilmiştir. Etken mikroorganizmaların 338'i ETA, dokuzu balgam materyalinden üretilmiştir. En sık görülen etken mikroorganizmalar ETA örneklerinde; Acinetobacter baumannii 208 (%61.5), Pseudomonas spp. 53 (%15.6), Klebsiella pneumoniae 20 (%5.9), Staphylococcus aureus 18 (%5.3), Escherichia coli 9 (%2.6), balgam örneklerinde Acinetobacter baumannii 6 (%66,6), Pseudomonas spp. 2 (%22.2), Klebsiella pneumoniae 1 (%11.1)'dir. Kolonizasyon olan mikroorganizmalar ise; A.baumannii 272 (%28.3), Enterobactericae üyeleri 228 (%23.7), Pseudomonas spp. 131 (%13.6), Candida spp. 138 (%14.3) olarak saptanmıştır. En sık izole edilen A.baumannii, Pseudomonas spp. ve K. pneumoniae izolatlarının tamamının çoklu antimikrobiyal direnci olduğu izlenmiştir. HKP tanısı konulan hastaların enfeksiyonlarından 235’i ventilatör ilişkili pnömoni (VİP), 63’ü VİP dışı HKP olarak değerlendirilmiştir.
TARTIŞMA ve SONUÇ: HKP, YBÜ’lerinde sık görülen mortalitesi yüksek bir hastane enfeksiyonudur. YBÜ’lerinde HKP etkeni olan mikroorganizmaları ve antimikrobiyal duyarlılıklarını izlemek ampirik tedavide yol gösterici olduğu gibi mortalite ve morbiditeyi azaltmak için de önemlidir. Olguların çoğunun geç başlangıçlı, olması hastanede yatış süresinin HKP açısından önemli bir risk faktörü olduğunu göstermektedir. En sık etken A. baumannii olarak tespit edilmiş ve bu mikroorganizma için kolitsinin tedavide tek seçenek olduğu görülmüştür. Kolonize olan mikroorganizmaların zamanla etken haline dönüşebileceği unutulmamalı ve bu hastalar takip edilmelidir.

Anahtar Kelimeler: Hastane kökenli pnömoni, ventilatör ilişkili pnömoni, antimikrobiyal direnç, kolonizasyon

Yasemin Genç, Yakup Gürkan, İpek Mumcuoğlu, Dilek Kanyılmaz, Altan Aksoy, Neriman Aksu. Analysis of Nosocomial Pneumonia and Antimicrobial Resistance of Frequently Encountered Bacterial Isolates in Intensive Care Unit Patients. Turk Hij Den Biyol Derg. 2016; 73(4): 355-364

Corresponding Author: Yasemin Genç, Türkiye
Manuscript Language: Turkish
LookUs & Online Makale