ISSN: 0377-9777 / e-ISSN: 1308-2523
Molecular techniques for clinical diagnostic mycology [Turk Hij Den Biyol Derg]
Turk Hij Den Biyol Derg. 2015; 72(3): 263-272 | DOI: 10.5505/TurkHijyen.2015.99705

Molecular techniques for clinical diagnostic mycology

Nuri Kiraz
Cerrahpasa Medical Faculty University Of Istanbul, Dept Of Medical Microbiology, İstanbul, Turkey

Diagnosing fungal infections remains a problem,
particularly in the immunocompromised patient. The
clinical manifestations of invasive fungal infections
are usually not specific and can be produced by
other organisms and colonization is difficult to
distinguish from invasive disease. Existing diagnostic
tools often lack sensitivity. Thus, the combination of
various diagnostic tools is mandatory to allow earlier
diagnosis of systemic fungal infections. Microscopy,
culture based methods, antigen detection, and
molecular techniques may help to facilitate and
accelerate the diagnosis. Molecular methods are
being developed for the detection and identification
of fungi present in clinical samples at a very fast
rate, whether it is done by nucleic acid amplification
technology or by specific probes or nucleic acid
sequencing. However, no comparative studies have
been done to determine which are optimal and no
standards for testing have been developped to date.
Therefore, extensive validation and standardization
is needed, before molecular assays can be used in a
routine laboratory.

Keywords: Molecular diagnosis of fungal infections, fungus identification, molecular typing

Mikolojik klinik tanıda moleküler teknikler

Nuri Kiraz
İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji, İstanbul

Mantar hastalıklarının tanımı, özellikle bağışıklığı
baskılanmış hastalarda bir sorun olmaya devam
etmektedir. İnvaziv mantar enfeksiyonlarının
klinik yönleri genellikle özgül değidir, başka
mikroorganizmalar tarafından da oluşturulabilir
ve kolonizasyonu invaziv hastalıktan ayırt etmek
güçtür. Mevcut tanım yöntemleri ekseri duyarlılıktan
yoksundur. Böylece, sistemik mantar enfeksiyonlarının
erken tanımı için çeşitli tanım yöntemlerinin birlikte
kullanılması gerekmektedir. Mikroskop incelemesi,
kültüre dayalı yöntemler, antijen aranması ve moleküler
teknikler tanımı kolaylaştırabilir ve hızlandırabilir.
Klinik örnekte bulunan mantarın belirlenmesi
ve tanımlanması için nükleik asit amplifikasyon
teknolojisi, özgül problar ve nükleik asit sekanslama
moleküler teknikleri çok hızla gelişmektedir. Ancak
hangisinin en uygun olduğunu belirlemek için henüz
karşılaştırmalı çalışmalar bulunmamaktadır ve bugüne
kadar testlerin standartlaştılması geliştirilememiştir.
Dolayısıyla, moleküler testlerin rutin laboratuvarlarda
kullanılabilmesi için önce geçerli kılınmalarına ve
standartlaştırılmalarına gereksinim bulunmaktadır.

Anahtar Kelimeler: Mantar enfeksiyonları moleküler tanı, mantarın tanımı, mantarların moleküler tiplendirilmesi

Nuri Kiraz. Molecular techniques for clinical diagnostic mycology. Turk Hij Den Biyol Derg. 2015; 72(3): 263-272

Corresponding Author: Nuri Kiraz, Türkiye
Manuscript Language: English
LookUs & Online Makale