ISSN: 0377-9777 / e-ISSN: 1308-2523
Turkish Bulletin of Hygiene and Experimental Biology - Turk Hij Den Biyol Derg: 68 (4)
Volume: 68  Issue: 4 - 2011
RESEARCH ARTICLE
1.Distribution of intestinal parasites in patients presented at the Parasitology Laboratory of the Medical School of Mustafa Kemal University during the Years 2006 and 2010
Gülnaz Çulha, Burcu Gülkan
doi: 10.5505/TurkHijyen.2011.16013  Pages 165 - 174
AMAÇ: Bu çalışmada Mustafa Kemal Üniversitesi Tıp Fakültesi Parazitoloji Laboratuvarına Ocak 2006-Mayıs 2010 tarihleri arasında başvuran toplam 9421 kişinin dışkı örneği retrospektif olarak bağırsak parazitleri yönünden araştırılmıştır. Ayrıca bu kişilerden selofanlı lam örneği alınabilen 781 olgunun preparatları incelenerek Enterobius vermicularis yumurtası aranmıştır Çalışmamızda hastanemiz parazitoloji laboratuarı kayıtları geriye dönük olarak taranarak bağırsak parazit sıklığının saptanması ve bu sonuçların yıllık değişiminin önceki yıllarla ve diğer çalışmalarla karşılaştırılması amaçlanmıştır.
YÖNTEMLER: Toplam 9427 kişiden alınan dışkı ve 781 kişiden alınan selofanlı lam örnekleri incelenmiştir. Dışkı örneklerine, önce makroskobik, nativ-lügol ile inceleme ve formolle çöktürme yöntemleri uygulanmıştır. X10’luk ve X40’lık büyütmelerle protozoon (kist veya trofozoiti) ve helmint (yumurta veya larva) varlığı araştırılmıştır. Alınan selofanlı lam preparatları ise X10’luk ve X40’lık büyütmelerle direk mikroskobik incelemeleri yapılarak E. vermicularis yumurtası aranmıştır
BULGULAR: Başvuranların 5146 (%52,6)’sı kadın 4275 (%45,4)’i erkek olmak üzere toplam 9421 dışkı örneği incelenmiştir. 835 (%48,3)’i erkek, 893 (%51,7) kadın olmak üzere toplam 1728 (%18,3) olguda bağırsak paraziti bulunmuştur. İncelenen 781 selofanlı lam örneğinin 410 (%52,5)’u kadın, 371 (47,5)’i ise erkek olguya aittir. İncelenen selofanlı lam örneklerinde 96 (%53,3)’sı erkek 84 (%46,7)’ü kadın olmak üzere toplam 170(%95,5) olguda E. vermicularis ve 10(%5,5) olguda Taenia spp yumurtası saptanmıştır. Dışkı inceleme sonuçları değerlendirildiğinde parazitlerin türlere göre dağılımı şöyledir; Blastocystis hominis 882(%51,0), Giardia intestinalis 313(%18,1), Entamoeba coli 268(%15,5), Entamoeba histolytica/dispar 129(%7,5), Chilomastix mesnilii 42(%2,4), Hymenolepis nana 35(%2.0), Strongyloides stercoralis 18(%1,0), Dicrocoelium dentriticum 13(%0,8), E. vermicularis 12(%0,7), Taenia spp, 6(%0,4), Iodamoeba butschlii 5(%0,3), Trichuris trichiura 2(%0,1), Ascaris lumbricoides 2 (%0,1), Balantidium coli 1(%0,1).
SONUÇ: Hatay da geçmiş senelerde yapılan çalışmalara göre bağırsak parazit oranları düşük bulunmuştur.Ancak barsak parazitleri halk sağlığı için önemli bir problem olarak devam etmektedir
OBJECTIVE: In this study, it was aimed to evaluate the prevalence of intestinal parasites of
the patients who applied to Parasitology Laboratory Mustafa Kemal University Medical Faculty province from 2006 to 2010 retrospectively. 781 cellophane tape preparations were examined directly Enterobius vermicularis eggs were investigated. The aim of this study was to determine the prevalence of intestinal parasites and to evaluate changes in the annual rates by retrospective screening of the data from our hospital parasitology laboratory.
METHODS: In this study carried out from January 2006-June 2010, a total of 9427 stool samples were examined using native-Lugol and flotation/sedimentation methods and 781 cellophane tape preparations were examined directly. At stool samples, firstly macroscopic investigating for helmint adult afterwards nativ lügol and formaldehyde precipitation performed and with microscope at X10, X40 magnifications to determine protozoon (cyst or trophozoites ) and helmint (egg and larvae) occurance. Preperats with cellophaned tape were investigated to determine E. vermicularis egg at microscope magnifications with X10, X40.
RESULTS: A total 9421 stool specimens from 5146 (% 54,6) males and 4275 (45,5%) females for intestinal parasites were examined. Intestinal parasites were found in 835(48,3%) male and 893 (%51,7) females. One or more intestinal parasites were detected in 1728 (%18,3) patients. A total of 781 cellophane tape specimens were examined 371 (%47,5) male and 410(%52,5) female. E.vermicularis was found in a total of 170 (8.72%) patients; of whom 65 (9.8%) were male patients and 85 (8.0%) female. The distribution of intestinal parasites detected in stool specimens were follows; Blastocystis hominis 882(%51,0), Giardia intestinalis 313(%18,1), Entamoeba coli 268(%15,5), Entamoeba histolytica/dispar 129(%7,5), Chilomastix mesnilii 42(%2,4), Hymenolepis nana 35(%2.0), Strongyloides stercoralis 18(%1,0), Dicrocoelium dentriticum 13(%0,8), E. vermicularis 12(%0,7), Taenia spp, 6(%0,4),Iodamoeba butschlii 5(%0,3), Trichuris trichiura 2(%0,1), Ascaris lumbricoides 2 (%0,1), Balantidium coli 1(%0,06)
CONCLUSION: The prevalence rates in this study seemed to be lower when compared to the previous studies in Hatay. It has been shown that intestinal parasites are still important for public health problem.

FULL JOURNAL
2.2011-4 Full Printed Journal

Pages 165 - 257
Abstract |Full Text PDF

RESEARCH ARTICLE
3.Microorganisms isolated from blood cultures during the period of one year at the 82nd Year Rize State Hospital and their susceptibility to antibiotics
Ayşegül Çopur Çiçek, Zeynep Şentürk Köksal, Ayşe Ertürk, Ersin Köksal
doi: 10.5505/TurkHijyen.2011.66588  Pages 175 - 184
AMAÇ: Şubat 2010 ve Şubat 2011 tarihleri arasında Rize 82.Yıl Devlet Hastanesi Mikrobiyoloji Laborotuvarına gönderilen kan kültür örneklerinden izole edilen çeşitli mikroorganizmalar ve antibiyotiklere duyarlılıkları retrospektif olarak araştırılarak antibiyotik kullanım politikalarına katkıda bulunulması amaçlanmıştır.
YÖNTEMLER: Bu süre içerisinde laboratuvara 900 kan kültürü örneği gelmiştir. Laboratuvarımıza gönderilen kan kültürü örnekleri bifazik Rosmedia (GBL), besiyerine ekilmiş ve rutin prosedürlerine uygun olarak EMB ve koyun kanlı agara pasajlanmıştır. Üreme sonrası mikroorganizmaların identifikasyonu koloni morfolojisi, Gram boyama ve biyokimyasal testleri içeren konvansiyonel yöntemlerle yapılmıştır. Antibiyotik duyarlılıkları Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) önerilerine göre Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile belirlenmiştir.
BULGULAR: : Laboratuvara gelen kan kültür örneklerinin 750’sinde (%83.3) üreme olmamış, 15 örnek (% 1.7) kontaminasyon olarak değerlendirilmiştir. Örneklerin 135’inde (% 15.0) çeşitli mikroorganizmalar izole edilmiştir. Bu mikroorganizmaların 108’i (%80.0) Gram-pozitif bakteriler, 23’ü (% 17.0) Gram-negatif bakteriler ve 4’ü (% 3.0) Candida spp. olarak bulunmuştur. Gram-pozitif bakterilerden 94’ü (%87.0 ) koagülaz-negatif stafilokok (KNS), 4’ü (%3.7) S.aureus ve 10’u (%9.3) Enterococcus spp. idi.
Metisilin direnci KNS’da % 70.2, S. aureus’ta % 50.0 olarak bulunmuştur. Stafilokoklarda ve enterokoklarda glikopeptit direncine rastlanmamıştır.Gram negatif bakterilerden 6 (%26.0)’sı Escherichia coli (E.coli), 5 (%21.7)’i Klebsiella spp., 5 (%21.7)’i Pseudomonas spp., 7 (%30.4)’si Acinetobacter spp., olarak tanımlanmıştır. Gram-negatif bakterilerden en sık izole edilen E.coli, Klebsiella spp. ve Pseudomonas spp. izolatlarında en duyarlı antimikrobiyal imipenem olarak bulunmuştur. Yoğun bakım ünitesinde üreyen Acinetobacter spp. izolatlarının 6 (%85.7)‘sı imipeneme dirençli bulunmuştur.


SONUÇ: Bakteriyemi etkenleri arasında önemli yer tutan bakterilerin tanımlanması için kanın alınış tekniğinden başlanarak kan kültürleri konusunda hastane personeline eğitim verilmeli, en az iki şişe kan kültürü gönderilmesi konusunda klinikler bilgilendirilmeli ve bunların sonucunda kan kültürlerinin daha etkin çalışılması için otomatize sistemlere geçilmelidir. Ayrıca bakteriyemi etkenlerinin direnç profillerinde de zamanla değişim olduğundan antibiyotik tedavi stratejilerini belirlemek için bu etkenlerin antibiyotik direnç oranlarının takip edilmesi gerekmektedir.
OBJECTIVE: The microorganisms which were isolated from blood cultures and their antibiotic susceptibilities during the between February 2010 and February 2011 in Microbiology Laboratory of Rize Central Hospital were assessed retrospectively, and aimed to contribute to antibiotic usage policies.
METHODS: : During this period, 900 blood culture samples were sent to our laboratory. Blood culture samples which send to our laboratory added to biphasic blood culture medium (Rosmedia, GBL) and were inoculated both sheep blood agar and EMB agar in accordance with routine procedures. After growth, microorganisms were identified with colony morphology and conventional methods which containing gram staining and biochemical tests. Antibiotic susceptibility was determined by Kirby-Bauer disk diffusion method according to the recommendations of Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI).


RESULTS: There was no growth in 750 of these samples (83.3% ) and 15 samples were (1.7 %) accepted as contamination. Various bacteria were determined in 135 samples (15.0 %); 108 of these organisms were (80.0 %) gram-positives, 23 were (17.0 %) gram-negatives and 4 were (3.0 %) Candida spp.
Coagulase Negative Staphylococcus (CNS) were the most frequently isolated species 94 (%87.0), followed by Staphylococcus aureus (S. aureus) 4 (%3.7), and Enterococcus spp. 10 (%9.3 ). Methicillin resistance were in 70.2 % of CNS and in 50.0 % of S.aureus. Glucopeptide resistance was not found in Staphylococcus and Enterococcus. The most frequently isolated Gram-negative species were Escherichia coli 6 (26.0%), Klebsiella species 5(21.7%), Pseudomonas spp. 5 (21.7%), Acinetobacter species 7(30.4%).
The most effective antibiotics were found as imipenem for the isolates of E.coli, and Klebsiella species and Pseudomonas spp. which were the most frequently isolated Gram-negative bacteria. But imipenem resistance was found 6(85.7%) of Acinetobacter spp. isolates which growth in the intensive care unit.


CONCLUSION: For determination of important bacteremia factors, the hospital staff should be given training on concerning blood collection techniques, the clinics should be informed about sending at least two blood culture bottles, and as a result of these, for studying more effectively, blood culture systems should be automated. Also, following the rates of antibiotic resistance would be in place approach for the determination of antibiotic treatment strategies because of changing the resistance of bacteria which important factors causing bacteremia.



4.Pandemic influenza A/H1N1 vaccination and vaccine-related side effects in health care workers of GATA Haydarpasa Training Hospital
Sinem Budak, Ali Acar, Zehra Karacaer, Hüsrev Diktaş, Vedat Turhan, Oral Öncül, Levent Görenek
doi: 10.5505/TurkHijyen.2011.78055  Pages 185 - 190
AMAÇ: Dünya Sağlık Örgütü, 2009 yılında ortaya çıkan influenza A H1N1 pandemisi ile mücadelede, sağlık çalışanlarının aşılanmasının birinci öncelikli hedef olması gerektiğini bildirmiştir. Kısa ve uzun vadede aşı yan etkileri konusundaki belirsizlik tartışma konusu olmuş ve aşıyı kabul etmeyi etkileyeceği öne sürülmüştür. Bu çalışmada sağlık çalışanları arasında pandemik influenza A/H1 N1 aşılamasını kabul etme, aşı ile ilişkili yan etkiler ve bu etkilerin görülme sıklığını belirlenmesi amaçlanmıştır.
YÖNTEMLER: 20 Kasım-01Aralık 2009 tarihleri arasında GATA Haydarpaşa Eğitim Hastanesinde sağlık çalışanları arasında pandemik influenza aşı uygulamasını kabul etme ve aşı ile ilişkili yan etkiler prospektif gözlemsel olarak araştırılmıştır. Gönüllü olarak aşı uygulanan personel üç gruba sınıflandırılmıştır. Her grup için aşılanan personel ile ilgili klinik bilgiler ve aşı uygulaması sonrası saptanan yan etkiler hazırlanan formlara kayıt edilmiştir.
BULGULAR: Toplam 1185 sağlık personeli çalışanımız arasından gönüllü olan 669’una pandemik influenza A H1N1 aşısı uygulanmıştır. Aşılanan personelin aşılamayı kabul etme yüzdeleri incelendiğinde doktor grubunda oran %84,3 (291/ 345), hemşirelerde %52,9 (198/ 374), yardımcı sağlık personelinde ise % 38,6 (180/ 466) olduğu saptanmıştır. Aşılama sonrası 14 gün aktif, sonraki bir yıl içerisinde bildirime dayalı pasif sürveyans ile pesonel takip edilmiştir. Toplam 261 (%38,6) aşı ile ilişkili yan etki belirlenmiştir. Aşılanan personelin 62(%9)’si sadece lokal, 89(%13,3)’u ise lokal ve sistemik yan etkileri birlikte bildirmiştir. En sık yan etki, aşı uygulanan bölgede ağrı (%17,3), (%7,6) halsizlik, ve (%6,7) baş ağrısı olarak saptanmıştır. Aşılanan personelin hiçbirisinde hayatı tehdit eden ciddi yan etki belirlenmemiştir.
SONUÇ: Halk sağlığını tehdit eden durumlarda, özellikle sağlık hizmetlerinde görevli personelin daha iyi bilgilendirme ve eğitimi ile önyargı oluşmasını önleyerek aşıya uyumu sağlanması salgın kontrolünde en önemli adımlardan birisidir.
OBJECTIVE: Vaccination of health care workers was declared as first step by WHO in encountering with influenza H1N1 pandemia in 2009. But the insignificance of long and short term side effects can effect the acceptibility of vaccination among health care workers
In our study we investigated pandemic influenza A H1 N1vaccination for health care workers for acceptibility of vaccination, side effects and their incidence among healthv care workers.
METHODS: Records of the vaccinated healt care workers between 20 November 2009 and 01 December 2009 were examined for acceptence and side effects prospectively. Voluntarily vaccinated personnel assigned into three groups. For all groups, clinical data of the vaccinated personnel and side effects detected after vaccine administration were recorded to the forms we prepared.
RESULTS: 669 of total 1185 healthcare workers were vaccinated voluntarily with Pandemic influenza A H1N1 vaccine. Vaccination response rates were %84,3 (291/ 345) for doctors, %52,9 (198/ 374) for nurses and % 38,6 (180/ 466) for other personnel. Cases were fallowed with active surveillance in first 14 days, than with passive surveillance for a year. Totally 261(%38.6) side effects related to vaccination was reported. 62 (%9) patients reported local; 89 (%13,3) patients reported systemic and local side effects together. The most frequent side effect was pain on injection site (%17,3), dizziness(%7,6) and headache(%6,7). Life threatening and serious side effects were not determined in any of the vaccinated personnel.
CONCLUSION: In situations concerning public health as Influenza H1N1 pandemia, proper education and informing of healthcare workers is important in order to prevent prejudice and to establish an effective vaccination campaign which will provide control of infection.

5.Evaluation of HCV RNA levels in samples with low anti-hepatitis C virus antibodies at Tepecik Education and Research Hospital
Şükran Köse, Gülfem Ece, Pınar Şamlıoğlu, Selim Topaloğlu
doi: 10.5505/TurkHijyen.2011.44154  Pages 191 - 196
AMAÇ: Hepatit C virus (HCV) infeksiyonu dünya çapında bir sağlık sorunudur. Dünya sağlık örgütü verilerine göre her yıl yaklaşık dört milyon kişi bu virus ile infekte olmakta; 350000 kişi HCV ile ilişkili karaciğer hastalıklarından hayatını kaybetmektedir. HCV; Flaviviridae ailesinden bir RNA virusudur. HCV, akut ve kronik hepatitlerin ana nedenlerindendir. Başlıca bulaşma yolu kan transfüzyonudur. Doku transplantasyonu, damar içi uyuşturucu kullanımı, cinsel temas, perinatal, perkutan yolla bulaşma, kontamine aletlerin kullanımı da HCV’nin bulaş yolları arasındadır. Bu çalışmamızın amacı.....Eğitim ve Araştırma Hastanesi İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarına gelen serum örneklerinde düşük düzeyde anti-hepatit C virus (Anti-HCV) pozitifliği saptanan örneklerin HCV RNA düzeylerinin değerlendirilmesidir.
YÖNTEMLER: Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarına 1 Eylül 2009 ve 10 Haziran 2010 tarihleri arasında gönderilen serum örnekleri anti-HCV açısından kemilüminesan tekniği (Architect i1000,Abbott, ABD) ile çalışıldı. HCV RNA testi ise COBAS AmpliPrep/ COBAS AMPLICOR HCV Test (Roche, İsviçre) ile çalışıldı.
BULGULAR: Toplam 4741 serum örneği incelenmiştir. Bunların 204’ü Anti-HCV pozitif olup yirmisi düşük pozitiftir (sample/cutoff [S/CO])1-2). Düşük pozitif örneklerin hiçbirisinde HCV RNA saptanmamıştır.
SONUÇ: Bizim çalışmamızda; yirmi düşük titreli serum örneğinin hiçbirinde HCV RNA pozitifliği saptanmamıştır. Anti-HCV antikorları saptanan serum örnekleri öncelikle enzim immunoassay (EIA) ile tekrar edilmeli; doğrulama için HCV RNA testi yapılmalıdır. EIA ve moleküler testlerin birlikte kullanılması pozitif sonuçların doğrulanmasına ve erken tanıya yardımcı olacaktır. Günümüzde anti-HCV taramalarında ikinci ve üçüncü kuşak EIA testlerinden yararlanılmaktadır. Üçüncü kuşak kitlerin ikinci kuşağa göre yalancı pozitiflik oranı düşük ve duyarlılığı %95’in üzerindedir. Buna karşın yalancı düşük pozitiflikler olabilmektedir. Bunların da HCV RNA bakılarak ayırıcı tanısının yapılması gereksiz tedavi maliyetlerinin azaltılmasında önemlidir.
OBJECTIVE: Hepatitis C virus (HCV) infection is a global health problem. According to WHO data; and there are four million people infected with the hepatitis C virus (HCV) and 350 million people die due liver diseases associated with this virus. HCV; is a RNA virus belonging to Flaviviridae family. HCV is a major cause of acute and chronic hepatitis. Transmission is mainly due to infected blood transfusion. Organ transplantation, intravenous drug use, sexual intercourse, and perinatal transmission are other causes of spreading. The aim of this study was to determine the low levels of anti-HCV from the serum samples received at..... Education and Research Hospital Infectious Diseases and Clinical Microbiology Laboratory and evaluate their HCV RNA assay results.

Hepatitis C virus (HCV) infection is a global health problem. According to WHO data; and there are four million people infected with the hepatitis C virus (HCV) and 350 million people die due liver diseases associated with this virus. HCV; is a RNA virus belonging to Flaviviridae family. HCV is a major cause of acute and chronic hepatitis. Transmission is mainly due to infected blood transfusion. Organ transplantation, intravenous drug use, sexual intercourse, and perinatal transmission are other causes of spreading. The aim of this study was to determine the low levels of anti-HCV from the serum samples received at..... Education and Research Hospital Infectious Diseases and Clinical Microbiology Laboratory and evaluate their HCV RNA assay results.


METHODS: Serum samples received at.....Education and Research Hospital Infectious Diseases and Clinical Microbiology Laboratory between September 1st 2009 and 10th of July 2010 were studied by the anti-HCV chemiluminescent assay (Architect i1000, Abbott, USA) and HCV RNA assay was studied by COBAS AmpliPrep / COBAS AMPLICOR HCV Test (Roche diagnositics, Switzerland).
RESULTS: A total of 4741 serum samples were studied. 204 of them were Anti- HCV positive and twenty of these were low positive (sample/cutoff [S/CO]) 1-2). None of these low positive samples had HCV RNA detected.
CONCLUSION: In this study; none of the twenty samples with low anti-HCV positivity had HCV RNA detected. Serum samples with low anti-HCV positivity should be studied once again by enzyme immuno assay (EIA) and applied HCV RNA for confirmation. The use of both EIA and molecular methods help cofirmation of positive assay results and early diagnosis. Currently, laboratories use either “second-” or “third-generation” EIA tests that detect antibodies against different regions of the HCV genome. The sensitivity of the third generation assay is more than 95% and there are less false positive results. Against all; there may be false positivity for anti-HCV chemiluminescent assay reults and they should be confirmed by HCV RNA assay so that unnecessary treatment can be avoided.

CASE REPORT
6.Burkholderia cepacia sepsis observed in a hospitalized patient with Guillain-Barre syndrome
Orhan Baylan, Mehmet Burak Selek, Semih Alay, Oral Öncül, Mustafa Özyurt, Tunçer Haznedaroğlu
doi: 10.5505/TurkHijyen.2011.67799  Pages 197 - 202
Burkholderia cepacia, yoğun bakım ünitelerinde takip edilen, özellikle kistik fibrozisli veya bağışıklık sistemi baskılanmış hastalarda nekrotizan pnömoni, sepsis/bakteriyemi ve salgınlara yol açan fırsatçı gram negatif basildir. Bu olgu sunumunda, Guillain-Barre sendromu nedeniyle hastanemizin nöroloji servisi yoğun bakım ünitesinde yatmakta iken 15 gün içerisinde değişik zamanlarda alınan üç seri kan kültür örneğinde B. cepacia üreyen, bağışıklık sistemi yeterli bir sepsis olgusu sunulmuştur. İzolatın, “Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI)” kriterleri doğrultusunda Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemiyle yapılan antibiyotik duyarlılık testinde trimetoprim-sulfametaksazol, seftazidim ve meropeneme duyarlı, minosikline orta duyarlı olduğu tespit edilmiştir. Hastanın mevcut kolistin ve levofloksasin kombinasyon tedavisine doripenem eklenmiştir. Tedavinin üçüncü gününde ateş yanıtı alınan hastanın antibiyotik tedavisi 14 güne tamamlanmış, hasta tedavi bitiminde herhangi bir komplikasyon gelişmeksizin iyileşmiştir. Aynı dönemde nöroloji yoğun bakım ünitesinden kaynak araştırması amacıyla alınan çevresel örneklerin hiçbirisinden söz konusu etken üretilememiştir. Bağışıklık sisteminde sorun olmasa da uzun süre hastanede yatan, kataterli ve tıbbi cihazlara bağlı yoğun bakım ünitesi olgularında B. cepacia sepsis görülebileceği akılda tutulmalıdır.
Burkholderia cepacia, is an opportunistic gram negative bacillus, that causes necrotizing pneumonia, sepsis/bacteremia and epidemics especially in cystic fibrosis or immunosupressed patients hospitalized in intensive care units. In this case report, we present a case of B. cepacia sepsis in an immunocompetent patient with a diagnosis of Guillain-Barre syndrome who was hospitalized in the neurological intensive care unit. B. cepacia was isolated from three blood culture sets taken one week apart. The antibiotic susceptibility testing of the isolates was performed by Kirby-Bauer disc diffusion method according to the “Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI)” criteria. The isolates were found to be susceptible to trimethoprim/sulfamethoxazole, ceftazidime and meropenem, and intermediately susceptible to minocycline. Doripenem was added to his ongoing combination therapy with colistin and levofloxacin. On the third day of the treatment, fever response is acquired, antibiotic therapy was prolonged to 14 days and at the end of the therapy the patient was cured without any complications. In the mean time, the agent could not be isolated from any of the environmental samples that were taken from the neurological intensive care unit. B. cepacia sepsis can be seen in cases with prolonged hospitalization, indwelling catheters and bounded to medical devices in intensive care units, even if they are not immunosupressed.

7.A pediatric case report of gastroenteritis caused by verocytotoxin producing Escherichia coli (VTEC) and enteric adenovirus
Recep Kesli, Huseyin Bilgin, Melike Emiroglu
doi: 10.5505/TurkHijyen.2011.78941  Pages 203 - 208
Gastroenterit etkenlerinin saptanması hastalığın tedavisi ve prognozunun öngörülmesinde önemlidir. Verotoksin üreten E. coli O157 H7 zoonotik patojen olup insanlarda hemorajik kolit, hemolitik üremik sendrom gibi bir çok hastalıkla ilişkilidir. Enterik adenovirüs, en sık 0-3 yaş grubu çocuklarda akut ve uzamış ishal nedeni olarak sıklıkla karşımıza çıkmaktadır. Üst solunum yolu infeksiyonu sırasında ve sonrasında dışkıda bulunabilmektedir. Ancak, serotip 40,41 ve nadiren 31 gastroenterite neden olabilmektedir Burada 3.5 yaşındaki kız hasta, iki gündür ishal ve kusma, dünden beri de mevcut olan ateş yakınmalarıyla başvuran ve gayta numunesinde verotoksin üreten E. coli ve adenovirüs tespit edilen bir hasta sunulmuştur. Bu olgu sunumunda adenovirüs ve ülkemizde nadir rastlanan verotoksin üreten E. coli klinik ve epidemiyolojik önemi yönünden tartışıldı.
It is important determination of etiology of gastroenteritis in predicting the treatment and prognosis of the disease. Verotoxin producing E. coli O157 (VTEC O157) is a zoonotic pathogen associated with a broad spectrum of human diseases, including haemorrhagic colitis and haemolytic–uraemic syndrome. Enteric adenovirus appears most often in children aged 0-3 years as a cause of acute and prolonged diarrhea. Here we presented 3.5 year-old girl who suffering from fever since yesterday and diarrhea and vomiting for two days. Verotoxin-producing E. coli and adenovirus was detected in stool samples. In this case report adenovirus and E. coli that is rarely determined in our country discussed with the aspect of the epidemiological and clinical significance.

8.Hantavirus infection with a mild course in a patient from Giresun province: A case report
Ahsen Öncül, Safiye Koçulu, Dilek Yağçı-çağlayık, Yavuz Uyar
doi: 10.5505/TurkHijyen.2011.26023  Pages 209 - 214
Ülkemizde son birkaç yıldır gündeme gelen hantavirüs enfeksiyonları kronik olarak enfekte olan rodent çıkartılarının inhalasyonu ile nadiren rodent ısırığı yoluyla bulaşan zoonotik enfeksiyonlardır. Avrupa’da rodent popülasyonundaki değişikliklere bağlı olarak aralıklı salgınlarla artan sayılarda olmak üzere endemik görülen bölgeler mevcuttur. Ülkemizde ise 2009 yılında Zonguldak-Bartın bölgesinde 12’si serolojik olarak doğrulanmış 25 vakanın görüldüğü ilk salgın ardından sporadik olgular bildirilmektedir. Bu raporda başlangıçta renal yetmezliği olmayan, ateş yüksekliği ve gastroenterit tablosu ile başvurup hafif trombositopeni saptanan bir vaka sunulmuştur. 45 yaşında bayan hastada kuru öksürük olması ve 2009 influenza salgını sırasında başvurması nedeniyle önce H1N1 influenzadan şüphelenilmiş, ardından sonucun olumsuz olması ve renal yetmezlik eklenmesi sonrasında hantavirüs enfeksiyonu düşünülmüştür. Refik Saydam Hıfzıssıhha Merkezi (RSHM) Viroloji Referans ve Araştırma Laboratuvarına gonderilen serum örneğinde İndirekt immunfloresans assay (IFA) yöntemi (Hantavirus Mosaic-1; Euroimmun, Almanya) ile hantavirus Dobrava IgM ve IgG antikorları ≥ 1: 100 titrede pozitif bulunmuş ve bu sonuç immunoblot (IB) yöntemiyle de (Hantavirus Profile 1 EUROLINE IgG ve IgM; Euroimmun, Almanya) pozitif olarak görülmüştür. Olgumuzda her iki yöntem ile de Dobrava serotipine karşı seropozitiflik saptanmıştır. Bu vaka dolayısıyla özellikle Karadeniz Bölgesindeki klinisyenlerin renal fonksiyon bozukluğu olmasa da ateş ve trombositopeni ile başvuran hastalarda Hantavirüs enfeksiyonunu da akla getirmesi gerektiğine dikkat çekilmek istenmiştir.
Hantavirus infections, which became a current issue last few years in our country are zoonotic infections that are transmitted through aerosols from chronically infected rodents excreta, and occasionally rodent bites. In Europe there are endemic regions that the disease is seen with increasing prevalence and intermittent outbreaks due to variations in rodent population. In our country sporadic cases are reported following the first outbreak in Zonguldak-Bartın region consisting of 25 cases, of whom 12 were serologically identified as Pumaala subtype in 2009. In this report a case that admitted to our clinic with fever and gastroenteritis, having mild thrombocytopenia but not renal involvement at admission. Forty-five years old women had been suspected of having H1N1 influenza as she had a dry cough, and her admission was during 2009 influenza outbreak, but after H1N1 tests were found to be negative and renal failure developed, hantavirus infection came into consideration. Patient’s serum sent to National Reference Virology Laboratory by IFA (Hantavirus Mosaic-1, Euroimmun, Germany) revealed hantavirus IgM and IgG antibodies ≥ 1: 100 titer and the results were also positive by immunoblot test (Hantavirus Profile 1 EUROLINE IgG and IgM, Euroimmun, Germany). In our patient, Hantavirus Dobrava subtype seropositivity was determined by two tests. With this report we aim to tell clinicians especially working in the Black sea region to take into consideration hantavirus infections for the patients admitting to hospitals with fever and thrombocytopenia, even if they do not suffer renal insufficiency.

REVIEW
9.The use of chitosan as a biological control remedy
Özlem İmamoğlu
doi: 10.5505/TurkHijyen.2011.55376  Pages 215 - 222
Hasat öncesi ve sonrası tarım ürünlerinin çoğunda toprak ve yaprak patojenleri, viral mikroorganizmalar, böcekler ve küfler nedeniyle kayıplar yaşanmaktadır. Ürünlerde meydana gelen bu bozulmalar, iç ve dış pazarda da ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Tarım ürünlerinde kayıpları azaltmak için uzun yıllardır kullanılan insektisit ve fungisitlerin yanlış ve bilinçsizce tüketimi hem insan sağlığını hem de doğayı etkileyerek biyolojik dengeyi bozmaktadır. Son yıllarda pestisitlere toleranslı patojen organizmaların ortaya çıkması, bu kimyasal ürünlerin yetersizliğini ortaya koymuştur. Tüm bu nedenlerle kimyasal kontrole alternatif, insan sağlığına zarar vermeyen, çevre dostu doğal ürünlerin biyolojik kontrol yöntemleri olarak kullanılabilirliği araştırılmaya başlanmıştır. Biyolojik kontrol pestisit kullanımı ile ilgili pek çok kaygıları gidermesi nedeniyle gelecek için cazip bir alternatif temsil etmektedir. Meyve ve sebzelerde küf, patojen gelişiminin kontrolünde, raf ömrünün uzatılmasında biyokontrol amaçlı doğal ürünlerin kullanımı oldukça ilgi çekmektedir. Bu doğal ürünler arasında uçucu bileşikler, asetik asit, jasmonat, propolis, kitosan, esansiyal yağ ve bitki ekstrakları sayılabilir.
Kitin, N-Asetil-D-glukozamin monomerlerinin (Glc-NAc) β-1,4 bağıyla bağlanması ile oluşmuş, selulozdan sonra en bol bulunan yenilenebilen doğal bir kaynaktır. Mantarların hücre duvarlarının ana bileşeni, kalamar ve ahtapot da dahil olmak üzere, eklembacaklılar, kabuklular, yengeç, ıstakoz, karides, böcekler, yumuşakçalar kafadan bacaklıların iskeletini oluşturmaktadır. Kitin bu kaynaklardan kimyasal yollarla elde edilmektedir. Kitinin kısmi deasitelasyonu ile meydana gelen kitosan antimikrobiyal, antifungal ve insektisidal aktiveteye sahip olması ile biyokontrol uygulamalarda kullanılmaktadır. Kitosanın çok sayıda tarım ürününde toprak ve yaprak patojenlerinin gelişimini engellediği, bitkilerde direnç mekanizmasını artırdığı ayrıca ürünlerin raf ömrünü uzattığı kanıtlanmıştır. Kitosan ve türevleri biyomedikal, gıda, ziraat, atık su arıtımı gibi birçok alanda kullanım olanakları ile ilgi çekmektedir.
Tarımsal ürünlerde küf, patojen ve diğer zararlıların gelişiminin engellenmesi ve/veya azaltılması ayrıca ürünlerin raf ömrünün uzatılması için doğal ürünlerin kullanılması konusunda yaygın araştırmalar yapılmasına ihtiyaç bulunmaktadır. Bu derlemede bazı doğal ürünlerin ve kitosanın biyokontrolde kullanımına yönelik değerlendirmelere yer verilmiştir.
Most of the pre- and post-harvest agricultural product losses due to, soil and leaf pathogens, viral microorganisms, insects and fungi. Spoilage of the product also cause economic losses in domestic and international market. Insectisides and fungicides are used for many years to reduce the losses of agricultural products and unconscious consumption of these chemicals affect both human health and disrupt the biological balance. In recent years the emergence of pesticide-tolerant pathogenic organisms, has revealed the inadequacy of these chemical products. For all these reasons an alternative to chemical control, do not harm human health, eco-friendly natural products as the availability of biological control methods of investigation was started. Due to many concerns about the use of biological pest control for the future, represents an attractive alternative. Using of natural products to control fungi and pathogens, prolong storage life of fruit and vegetables has received more and more attention. Some of the natural products are acetic acid, jasmonat, propolis, chitosan, essential oil and plant extracts.
Chitin, polymer of N-acetyl-D-glucosamine monomer (GlcNAc) residues linked by b-1,4 bonds, is the most abundant renewable natural resource after cellulose. It is the main component of the cell walls of fungi, the exoskeletons of arthropods such as crustaceans, crabs, lobsters, shrimps insects, the radulas of mollusks, cephalopods, octopuses. Chitin is obtained from these sources by chemical ways. Chitosan, which is derived by partial deacetylation of chitin, is a natural product and it has antimicrobial, antifungal and insectisidal activity using in biocontrol applications. Chitosan has been proven to inhibit to grow both soil and foliar plant pathogens, increase the mechanism of resistance in plants also extends the shelf life of various horticultural commodities. Chitosan and its derivatives are of interest because of their various biomedical, food, agriculture and waste water treatment applications.
In order to prevent and/or reduce fungi, pathogens and other pests, prolong storage shelf life of agricultural products common researches are needed about using natural product. In this review the use of natural products and chitosan are given assesment with the purpose of biocontrol.

10.Nutritional value and biological effects of macrofungi
Osman Üstün
doi: 10.5505/TurkHijyen.2011.00922  Pages 223 - 240
Makrofunguslar klorofil içermeyen, Fungi aleminde bulunan Basidiomycetes ve Ascomycetes sınıflarında yer alan canlılardır. Ülkemizde doğal olarak yetişen ve kültürü yapılan makrofunguslar gıda olarak tüketilmektedir. Yabani makrofunguslar orman köylülerinin başlıca geçim kaynağını oluşturmakta ve ülkemize de döviz girdisi sağlamaktadır. Makrofungusların yapısında su, protein, yağ ve karbohidrat gibi bileşenler bulunmaktadır. Fruktifikasyon organları % 80-95 oranında su içermektedir. En yüksek protein ve yağ içeriğine sahip olanlar Agaricus türleridir. Boletus edulis türü ise en yüksek oranda karbohidrat içermektedir. Makrofungusların geneline bakıldığında % 40’ın üzerinde karbohidrat ve % 20-40 arasında değişen oranda protein içerdikleri, buna rağmen yağ içeriklerinin % 8’lerin altında kaldığı tespit edilmiştir. Makrofungusların içerdikleri aminoasitler arasında en yüksek orana sahip olanlar glütamin, asparajin ve metiyonindir. Makrofunguslarda doymamış yağ asidi oranı doymuş yağ asidi oranına göre yüksek miktardadır. Linoleik, oleik ve palmitik asit en yüksek oranda içerdikleri yağ asitleridir. İnsan metabolizması için gerekli olan tiamin, riboflavin ve niasin gibi vitaminler de bileşimlerinde bulunmaktadır. Aynı zamanda makrofunguslar antioksidan etkiye sahip flavonoit, askorbik asit, β-karoten ve likopen yapısındaki maddeleri de içermektedir. Makrofunguslardan izole edilen etkili maddeler arasında β-glukanlar, ergon, ganoderik asit vb. bulunmaktadır. Besin değerlerinin yanı sıra makrofunguslar antimikrobiyal, antioksidan, antikanserojen ve immünostimülan gibi biyolojik etkilere sahiptirler. Yabani makrofunguslar kültüre alınmalı, bunlardan izole edilecek aktif bileşiklerin standardizasyonları sağlanmalıdır. Geniş bir biyolojik aktivite yelpazesine sahip olan makrofungusların günümüzde kullanılan ilaçlara alternatif olmaları için de aktivite çalışmalarının yoğunlaştırılması gerekmektedir.
Macrofungi, no chlorophyll containing, belong to Basidiomycetes and Ascomycetes classes in the kingdom of Fungi. Naturally grown and cultured macrofungi are consumed as a food source in our country. Wild macrofungi are a major source of living for forest loggers and thus brings income to the country as an export item. The content of macrofungi include water, protein, lipid, and carbohydrate etc. Their fructification organs contain 80-95% water. Agaricus species has the highest protein and lipid content. Boletus edulis species has the highest carbonhydrate content. It has been demonstrated that macrofungi, overall, have contain more than 40% carbonhydrate, between 20% and 40% protein, but less than 8% lipid. In terms of aminoacids in macrofungi, glutamine, asparagine, and methionine are found to be the highest ones. In macrofungi, unsaturated fatty acid ratio is higher than saturated fatty acid ratio. Linoleic, oleic, and palmitic acid are the highest ones. Macrofungi are also rich for essential vitamins for human metabolisms, including thiamine, riboflavin, and niacin. Macrofungi have also contained antioxidant flavonoid, ascorbic acid, β-carotene, and lycopene. Other effective substances obtained from macrofungi include β-glucans, ergon, ganoderic acid, etc. In addition to the nutritional benefits, it has been shown that macrofungi have also antimicrobial, antioxidant, anticancer, and immunostimulant activities. Given the fact that macrofungi have wide spectrum of biological effects, increasing efforts on culturing wild grown macrofungi and isolation and standardization of active substances of the macrofungi are needed in order to create alternatives to drugs used today.

11.Micronucleus test for determining genotoxic damage
Vedat Şekeroğlu, Zülal Atlı Şekeroğlu
doi: 10.5505/TurkHijyen.2011.06977  Pages 241 - 252
Bu derlemenin amacı hücrelerdeki genetik hasarın indirekt göstergesi olarak değerlendirilen mikronükleus (MN) tekniği hakkında bilgi vermektir. MN’ler hücrenin mitoz bölünmesi sırasında ortaya çıkan, esas çekirdeğe dahil olmayan, tam kromozom veya asentrik kromozom fragmentlerinden köken alan oluşumlardır ve MN sayısındaki artış, somatik hücrelerdeki genomik kararsızlığın göstergesidir. MN testi, fiziksel ve kimyasal ajanların hücrelerde oluşturduğu genotoksik etkinin belirlenmesinde yaygın olarak kullanılan bir testtir. Bu test mitoz bölünme ile oluşan hemen hemen tüm hücre tipleri üzerinde in vitro ve in vivo olarak uygulanabilmektedir ve kromozom anormallikleri testine göre daha kolay ve daha hızlı bir uygulamaya sahiptir. Kültürde bir kez bölünmesini tamamlamış binükleat hücrelerde MN frekansını saptayan ve sitokalasin-B ile sitokinezin bloklanmasına dayanan metodun gelişmesi ile MN testinin güvenilirliği ve geçerliliği artmıştır. MN testi aynı zamanda, in vitro çalışmalarda nükleer bölünme indeksi, in vivo çalışmalarda ise polikromatik eritrositler ile normokromatik eritrositler arasındaki oran kullanılarak sitotoksisitenin tahmin edilmesini de sağlamaktadır. İnsan ve diğer türler çevrelerinde bulunan çok sayıda farklı kimyasal ve fiziksel etkenlere maruz kalmaktadır ve bu nedenle kimyasal ve fiziksel faktörlerin potansiyel riskleri ve olumsuz etkilerini değerlendiren genotoksisite çalışmaları gittikçe artan bir şekilde önem kazanmaktadır. MN testi; fiziksel etkenlerin, ilaçların, çevresel kirleticiler ve gıda katkı maddeleri gibi günlük yaşamda sıklıkla maruz kaldığımız her türlü kimyasal maddenin genotoksik ve kanserojenik potansiyellerinin ve güvenilirliliklerinin araştırılmasını, kanser riskinin tahmin edilmesini ve kanserin izlenmesini sağlayan oldukça kullanışlı bir biyoizlem testidir. Basitliği, güvenirliliği, geçerliliği ve farklı hücre tiplerine uygulanabilirliği gibi avantajlara sahip olması nedeniyle yıllardır kullanılmakta olan MN testinin, gelecekte de mutajenitenin belirlenmesi ve önlenmesinde önemli bir rolü olacaktır.
The aim of this review is to give information about the principles and applications of the micronucleus (MN) technique which is considered to be an indirect indication for genetic damage in cells. Micronuclei are formed during the mitosis which does not integrate in main nucleus. They may arise from a whole lagging chromosome or an acentric chromosome fragment and, an increase of MN frequency indicates of genomic instability. MN test is commonly used to determine the genotoxic effect of chemical and physical agents on somatic cells. It is applied to substantially all types of cells reproducing by mitosis as in vitro and in vivo and it is easier and faster to perform than the chromosome aberration assay. With the development of the in vitro cytochalasin-B block method to detect MN frequency in binuclear cells which divided once in culture, its reliability and validity have increased. At the same time the test enables estimation of cytotoxicity using frequency of nuclear division index in in vitro or the ratio between polychromatic erythrocytes and normochromatic erythrocytes in in vivo. Human and other species are exposed to a large number of different chemical and phsylogical factors in their environment and therefore the genotoxic studies about the adverse effects and potential risk of the factors, gain ground exponentially. MN test is a practical bio-monitoring test that provides to investigate of genotoxic and carcinogenic potentials and reliability of physical agents, drugs, all types of chemical we are exposed to every day such as pollutants, food

LookUs & Online Makale