ISSN: 0377-9777 / e-ISSN: 1308-2523
Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi
2011-2014 yılları arasında kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal direnç durumları [Turk Hij Den Biyol Derg]
Turk Hij Den Biyol Derg. 2017; 74(1): 55-70 | DOI: 10.5505/TurkHijyen.2016.04809

2011-2014 yılları arasında kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal direnç durumları

Fatma Köksal Çakırlar1, Yavuz Uyar1, Sinem Özdemir1, Ayşe Barış2, Ezgi Gözün Şaylan1, Zafer Habip1, Hrisi Bahar Tokman1, Nevriye Gönüllü1, Murat Günaydın1, Nuri Kiraz1
1İstanbul Universitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Fatih / İstanbul
2İstanbul Şişli Hamidiye Etfal Eğitim ve Araştırma Hastanesi, İstanbul

GİRİŞ ve AMAÇ: Kan akım enfeksiyonları en yaygın nozokomiyal infeksiyonlardan olup önemli mortalite ve morbidite nedenlerindendir. Erken tanı ve tedavi hasta prognozu açısından büyük önem taşımaktadır. Bakteriyemi ve sepsis tanısı için en güvenilir yöntem kan kültürüdür. Bu çalışmada, xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na Ocak 2011 ve Aralık 2014 tarihleri arasında çeşitli kliniklerden gönderilen kan kültürlerinden, izole edilen mikroorganizmaların identifikasyonu ve antibiyotiklere direnç profillerinin belirlenmesi amaçlanmıştır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Kan kültürleri BACTEC 9120 (Becton-Dickinson Diagnostic Instrument Systems, USA) otomasyon sistemi ile çalışılmıştır. Mikroorganizmaların tanımlanması konvansiyonel yöntemler ve BD Phoenix Otomatize Mirobiyoloji Tanımlama Sistemi (Becton Dickinson and Company, Sparks, USA) kullanılarak yapılmıştır. Bakterilerin antibiyotik duyarlılıkları Kirby-Bauer disk difüzyon metodu ile çalışılmıştır ve Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) kriterlerine göre değerlendirilmiştir.
BULGULAR: Çalışmamızda 22.366 hastadan alınan toplam 50850 kan kültürü incelenmiştir ve kültürlerin 7510 (%14.7)’unda üreme saptanmıştır. Üreyen mikroorganizmaların 4894 (%67.5)’ü Gram pozitif kok (%71 plazma koagulaz negatif stafikok, %9 Staphylococcus aureus, %9 Enterococcus sp., %6 Streptococcus sp.), 181 (%2.4)’i Gram pozitif çomak, 2105 (% 28)’i Gram negatif çomak (%32.9 E.coli, %23.9 Klebsiella sp., %16 Pseudomonas auroginosa, %13 Acinetobacter sp., %5.8 Enterobacter sp.), 21 (%0.27)’i anaerob bakteri ve 305 (% 4)’i mantar türü (%96.7’si Candida sp.) olarak belirlenmiştir. Metisilin direnci, plazma koagulaz negatif stafilokoklar da %34, S.aureus’da %20.9 olarak tespit edilmiştir. Enterokoklarda vankomisin direnci %13 olarak saptanmıştır. Genişlemiş-spektrumlu beta-laktamaz oluşumu E.coli’de % 34 ve Klebsiella sp’de % 50 olarak bulunmuştur. Karbapenemaz üretimi E.coli’de % 8 ve Klebsiella sp’de % 17 olarak tespit edilmiştir.
E.coli ve Klebsiella sp’nin direnç oranları sırasıyla ampisiline %44.7 ve %100, gentamisine %26 ve %27, amikasine %15 ve %17, amoksisilin + klavulanik aside %30 ve %35, sefuroksime %41 ve %51, sefepime %35 ve %50), seftazidim ve sefotaksime %36 ve %50, siprofloksasine %39.5 ve %31.8’dir. Acinetobacter sp. ve P.aeruginosa’nın ise sırasıyla seftazidime %78 ve %22, siprofloksasine %64 ve %12.6, imipeneme %63.6 ve %26.5, gentamisine %56 ve %11.8, amikasine (%53 ve %7)), piperasilin + tazobaktama %58 ve %12), sefepime %61 ve %16.6, sefotaksime 74.7 ve %22 ve sefoperazon + sulbaktama %56.7 ve %11 olarak tespit edilmiştir.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Hastanemizde önemli problem olan metisiline direncli stafilokoklar, E. coli ve Klebsiella cinsi bakteriler, Pseudomonas ve Acinetobacter cinsi bakterilerin çoklu ilaç direncine sahip oldukları ve bu direncin zaman içinde değişim gösterdiği anlaşılmaktadır.

Anahtar Kelimeler: Kan akım enfeksiyonları, kan kültürü, antibiyotik, antimikrobiyal direnç

Microorganisms isolated from blood cultures between 2011 and 2014 and their state of antimicrobial resistance

Fatma Köksal Çakırlar1, Yavuz Uyar1, Sinem Özdemir1, Ayşe Barış2, Ezgi Gözün Şaylan1, Zafer Habip1, Hrisi Bahar Tokman1, Nevriye Gönüllü1, Murat Günaydın1, Nuri Kiraz1
1Istanbul University, Cerrahpasa School of Medicine, Dept. of Medical Microbiology, Istanbul, Turkey
2Istanbul Sisli Hamidiye Etfal Training and Research Hospital, Istanbul, Turkey

INTRODUCTION: Bloodstream infections are the most common nosocomial infections and significant reasons for mortality and morbidity. Early diagnosis and treatment are of vital importance in terms of patient prognosis. Blood culture is the most reliable method for the diagnosis of bacteremia and sepsis. The aim of this study was to identify the microorganisms isolated from the blood cultures sent to xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx Medical Microbiology Laboratory from various clinics between January 2011 and December 2014 and to determine antibiotic resistance profiles of these microorganisms.
METHODS: Blood cultures were studied by the BACTEC 9120 (Becton-Dickinson Diagnostic Instrument Systems, USA) automation system. The identification of the microorganisms was carried out by both conventional methods and BD Phoenix Automized Microbiology Identification System (Becton Dickinson and Company, Sparks, USA) Antibiotic susceptibility of the bacteria was studied with Kirby-Bauer disc diffusion method and evaluated as regards the criteria of Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI).
RESULTS: A total of 50.850 blood cultures taken from 22.366 patients were examined in this study and reproduction was detected in 7.510 (14.7%) of the cultures. 4.894 (67.5%) of the reproduced microorganisms were Gram positive cocci (71% plasma coagulase negative staphycoccus, 9% Staphylococcus aureus, %9 Enterococcus sp., and %6 Streptococcus sp.), 181 (2.4%) were Gram positive bacillus, 2105 (28%) were Gram negative bacillus (32.9% E.coli, 23.9% Klebsiella sp., 16% Pseudomonas aeruginosa, 13% Acinetobacter sp., and 5.8% Enterobacter sp.), 21 (0.27%) were anaerobe bacteria and 305 (4%) were fungus type (96.7% Candida sp.). Methicillin resistance was detected as 34% in plasma coagulase negative staphycocci and 20.9% in S. aureus. Vancomycin resistance in enterococcus was determined as 13%. Broad-spectrum beta-lactamase formation was found as 34% in E. coli and 50% in Klebsiella sp. Carbapenemase production was detected as 8% in E.coli and 17% in Klebsiella sp.
Resistance rates of E.coli and Klebsiella sp to ampicillin was respectively as 44.7% and 100%, to gentamicin as 26% and 27%, to amicasin as 15% and 17%, to amoxicillin+clavulanate acid as 30% and 35%, cefuroxime as 41% and 51%, to cefepime as 35% and 50%, to ceftazidime and cefotaxime as 36% and 50%, and to ciprofloxacin as 39.5% and 31.8%. Resistance rates of Acinetobacter sp. and P.aeruginosa to ceftazidime was respectively as 78% and 22%, to ciprofloxacin as 64% and 12.6%, to imipenem as 63.6% and 26.5%, to gentamicin as 56% and 11.8%, to amicasin as 53% and 7%, to piperacillin + tazobactam as 58% and 12%, to cefepime as s61% and 16.6%, to cefotaxime as 74.7% and 22%, and to cefoperazone + sulbactam as 56.7% and 11%.
DISCUSSION AND CONCLUSION: It is understood that Staphylococci resistant to methicillin, which is a significant problem in our hospital, bacteria like E. coli and Klebsiella, and bacteria like Pseudomonas and Acinetobacter are multiple-drug resistant and that this resistance has undergone a change over time.

Keywords: Bloodstream infections, blood culture, antibiotic, antimicrobial resistance

Fatma Köksal Çakırlar, Yavuz Uyar, Sinem Özdemir, Ayşe Barış, Ezgi Gözün Şaylan, Zafer Habip, Hrisi Bahar Tokman, Nevriye Gönüllü, Murat Günaydın, Nuri Kiraz. Microorganisms isolated from blood cultures between 2011 and 2014 and their state of antimicrobial resistance. Turk Hij Den Biyol Derg. 2017; 74(1): 55-70

Sorumlu Yazar: Fatma Köksal Çakırlar, Türkiye
Makale Dili: Türkçe
LookUs & Online Makale
w