Comparison of automated systems using liquid microdilution for the determination of colistin resistance in Klebsiella pneumoniae strains

INTRODUCTION: In the detection of colistin resistance in Klebsiella pneumoniae strains with multidrug resistance, automated systems give more erroneous results than the gold standard method, the liquid microdilution method. Comparative studies on the correct detection of colistin resistance by automated systems are limited in the literature. In this study; it is aimed to compare Vitek2 Compact and Phoenix automated systems by using liquid microdilution method in the determination of colistin susceptibility in K. pneumoniae strains isolated from various clinical specimens over a three-year period.


METHODS: Identification of K. pneumoniae strains was performed using conventional microbiological methods and automated bacterial identification systems which are Vitek2 (bioMérieux, MarcyL’Etoile, France) and Phoenix (Becton dickinson, M50, USA). Antibiotic susceptibility tests were also performed with the same devices. Colistin sensitivity was determined simultaneously with both automated methods and liquid microdilution method.


RESULTS: In our study, for the Vitek2 automated system, the Categorical Agreement (CA) ratio is 93.71%, the Very Major Error (VME) rate is 6.89%, and the Minor Error (ME) rate is 1.41%. For the Phoenix automated system, the CA ratio is 95.05%, the VME rate is 3.44%, and the ME rate is 1.51%.Vitek2; specificity is 86.10%, lambda value is 0.82, and kappa value is 0.83. For the Phoenix system, specificity is 88.20%, lambda value is 0.82, and kappa value is 0.87.


DISCUSSION AND CONCLUSION: In determining colistin susceptibility for K. pneumoniae, the Phoenix automated system was found to be more compatible with the reference method than the Vitek2 automated system, and more supportive multicenter studies are needed on this subject.

Klebsiella pneumoniae suşlarında kolistin direncinin saptanmasında otomatize sistemlerin sıvı mikrodilüsyon ile karşılaştırılması

GİRİŞ ve AMAÇ: Çoklu ilaç direncine sahip Klebsiella pneumoniae suşlarında kolistin direncinin saptanmasında otomatize sistemler altın standart yöntem olan sıvı mikrodilüsyon yöntemine göre hatalı sonuçlar vermektedir. Otomatize sistemlerin kolistin direncini doğru saptamasıyla ilgili kıyaslama yapılan çalışmalar literatürde kısıtlıdır. Bu çalışmada; üç yıllık dönemde çeşitli klinik örneklerden izole edilen K. pneumoniae suşlarında kolistin duyarlılıkların belirlenmesinde sıvı mikrodilüsyon yöntemi referans alınarak Vitek2 Compact otomatize sistemi ve Phoenix otomatize sisteminin duyarlılık sonuçlarının karşılaştırılması amaçlanmıştır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: K. pneumoniae suşlarının tanımlanması konvansiyonel mikrobiyolojik yöntemler ve otomatize bakteri tanımlama sistemi (Vitek2 bioMérieux, MarcyL’Etoile, Fransa) ve Phoenix otomatize sistem (Bectondickinson, M50, ABD) kullanılarak yapılmıştır. Antibiyotik duyarlılık testleri de yine aynı cihazlarla yapılmıştır. Kolistin duyarlığı ise hem otomatize yöntemlerle hem de sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile eş zamanlı olarak belirlenmiştir.

BULGULAR: Çalışmamızda; Vitek2 otomatize sistem için Kategorik Uyum (KU) oranı %93,71, Çok Büyük Hata (ÇBH) oranı %6,89, Büyük Hata (BH) oranı ise %1,41 tespit edilmiştir. Phoenix otomatize sistem için ise KU oranı %95,05, ÇBH oranı %3,44, BH oranı ise %1,50 olarak tespit edilmiştir. Vitek2 için; özgüllük %86,10, lambda değeri ise 0,82, kappa değeri 0,83 olarak tespit edilmiştir. Phoenix için ise; özgüllük %88,20, lambda değeri ise 0,82, kappa değeri 0,87 olarak tespit edilmiştir.
TARTIŞMA ve SONUÇ: K. pneumoniae için kolistin duyarlılığının saptanmasında Phoenix otomatize sisteminin Vitek2 otomatize sisteme göre referans yöntemle daha uyumlu olduğu tespit edilmiş olup, bu konuyla ilgili destekleyici çok merkezli daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır.K. pneumoniae için kolistin duyarlılığının saptanmasında Phoenix otomatize sisteminin Vitek2 otomatize sisteme göre referans yöntemle daha uyumlu olduğu tespit edilmiş olup, bu konuyla ilgili destekleyici çok merkezli daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır.